中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院長(zhǎng)江水產(chǎn)研究所鰱鱔遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在銀鲴種質(zhì)資源挖掘方面取得新進(jìn)展。
由于基因組資源的缺乏，銀鲴的系統(tǒng)發(fā)育、適應(yīng)性進(jìn)化策略，以及優(yōu)良性狀形成的遺傳基礎(chǔ)研究十分匱乏，制約了該物種資源的充分利用。研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合Pacbio CCS、Hi-C和Illumina測(cè)序技術(shù)對(duì)銀鲴基因組進(jìn)行組裝，獲得了一個(gè)高質(zhì)量的染色體水平銀鲴參考基因組。該基因組的大小為984.96 Mb，contig N50為36.02 Mb，其中99.47%的序列被掛載到24條染色體上，并且有18條染色體中沒(méi)有g(shù)ap。該基因組注釋到560.27 Mb的重復(fù)序列，以及28533個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。質(zhì)量評(píng)估顯示，該基因組的BUSCO評(píng)估值為97.2%，二代數(shù)據(jù)比對(duì)率達(dá)99.89%，堿基的質(zhì)量值（Qv）為52.22，并且掛載后的染色體基因組與近緣種細(xì)鱗斜頜鲴和團(tuán)頭魴展示出良好的共線性，顯示出該基因組較高的完整性、一致度和掛載準(zhǔn)確度。該研究成果為銀鲴的種質(zhì)資源鑒定評(píng)價(jià)、適應(yīng)性策略和優(yōu)良性狀的遺傳基礎(chǔ)等提供了參考，也為深入解析鯉科魚(yú)類的系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化歷史提供了支撐。相關(guān)研究成果在國(guó)際期刊Scientific Data在線發(fā)表。
銀鲴（Xenocypris argentea）是鯉科、鲴亞科的一種中小型淡水魚(yú)，廣泛分布在我國(guó)的主要水系和附屬湖泊中。它主要棲息在中下層水域，以腐殖質(zhì)、硅藻和附著藻類為食，常被用作工具魚(yú)凈化水質(zhì)。銀鲴生長(zhǎng)快、病害少、繁殖力強(qiáng)且適應(yīng)性強(qiáng)，可以生活在復(fù)雜多樣的水域中，常因地理隔離形成不同地理種群，遺傳資源豐富。
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