近日，珠江水產(chǎn)研究所育種室龜鱉遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在中華鱉性別研究領(lǐng)域取得系列進(jìn)展，相關(guān)研究成果“Identification of Sex-Specific Markers and Candidate Genes Using WGS Sequencing Reveals a ZW-Type Sex-Determination System in the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”發(fā)表于International Journal of Molecular Sciences（JCR Q1，IF2022=5.60），祝駿賢博士和汪泳昌碩士為共同第一作者，朱新平研究員和李偉副研究員為共同通訊；“Whole-Genome Identification and Characterization of the DKK Gene Family and Its Transcription Profiles: An Analysis of the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”發(fā)表于Animals（JCR Q1，IF2022=3.00），汪泳昌碩士和祝駿賢博士為共同第一作者，李偉副研究員和新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)張俊杰副教授為共同通訊。
上述研究得到了國家自然科學(xué)基金（32102792）、廣東省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳種業(yè)振興項(xiàng)目（2022-SJS-00-00；2022-SPY-00-015）和中國-東盟海洋合作基金（CAMC-2018F）等項(xiàng)目的資助。
研究開發(fā)了一套準(zhǔn)確、高效的工作流程，用于篩選具有ZW或XY性別決定系統(tǒng)物種的性別特異性序列。基于該流程，對(duì)中華鱉雌性和雄性參考基因組進(jìn)行了從頭組裝，經(jīng)過兩輪的比對(duì)和篩選，最終獲得了4.01 Mb的雌性特異性序列，并開發(fā)了7對(duì)性別特異性引物，且在初步驗(yàn)證、群體驗(yàn)證和胚胎驗(yàn)證中準(zhǔn)確率均為100%。通過對(duì)中華鱉雌性特異性序列的NR注釋，發(fā)現(xiàn)了42個(gè)性別決定候選基因，其中包括Ran、Eif4et、Crkl等。功能注釋的結(jié)果顯示，8個(gè)KEGG通路被顯著富集，其中胰島素信號(hào)通路和cAMP信號(hào)通路與性別決定相關(guān)。研究為中華鱉性控育種和性別決定機(jī)制的研究提供了有利的分子工具和潛在的分子靶標(biāo)。此外，研究還通過比較基因組研究，鑒定了中華鱉DKK基因家族成員，并通過系統(tǒng)發(fā)育、基因共線性、基因結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)域、保守motif、啟動(dòng)子保守位點(diǎn)、信號(hào)肽、轉(zhuǎn)錄因子、性腺轉(zhuǎn)錄譜和組織表達(dá)譜的系統(tǒng)分析，初步揭示了DKK基因家族成員在中華鱉性別發(fā)育中的潛在功能。
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